Liste des équipements utilisés par le pôle B2M :
Bioruptor Pico de Diagenode
Sonicateur d’ADN utilisé pour la préparation des librairies d’ADN génomique
Biosprint de Qiagen
Automate permettant l’extraction de l’ADN de 15 échantillons simultanément
Crosslinker UV de Boekel Scientific
Chambre UV utilisée pour la décontamination des consommables, pipettes, portoirs et autres matériels de laboratoire
Cuves d’éléctrophorèse
Cuves utilisées pour vérifier le succès d’amplifications PCR
Nanodrop One de Thermo Scientific
Spectrophotomètre à microvolume permettant la quantification d’ADN et d’ARN
TapeStation 4150 d’Agilent
Appareil d’électrophorèse automatisée pour le contrôle qualité des acides nucléiques. Nous l’utilisons pour contrôler la qualité des librairies et des échantillons d’ADN génomique
Thermocycleurs Biorad et Eppendorf
Appareils automatisant la PCR, par blocs de 96 ou 384 échantillons
Tissue Lyzer de Qiagen
Appareil permettant le broyage d’échantillons grâce à des billes
Robot pipetteur d’Integra
Le robot pipetteur permet l’automatisation de la préparation d’amorces tagguées afin de pooler de nombreux échantillons lors du métabarcoding.
QIAcuity One de Qiagen
Appareil de quantification de l’ADN par digital PCR, sur plaques de 8, 24 ou 96 échantillons. Jusqu’à 5 cibles différentes peuvent être multiplexées
QubitFlex et Qubit d’Invitrogen
Fluorimètres permettant la quantification d’ADN par barrette de 8 échantillons pour le QubitFlex et à l’unité pour le Qubit
Présentation des salles de manipulation de la B2M :
Salle préparation de milieux et tampons
Salle sans ADN nous permettant de préparer les milieux et tampons utiles à nos manipulations. Nous avons également dans cette salle la chambre UV ainsi qu’une étiqueteuse.
Salle ADN humain
Salle dans laquelle nous faisons les manipulation de l’extraction à la PCR sur des échantillons humains
Salle extractions
Nous avons 3 salles d’extractions de plantes, insectes, champignons, …
Salle pré-PCR
Salle de préparation des PCR et de la quantification des échantillons (Nanodrop, Qubit)
Salle préparation de librairies
Salle de préparation des librairies d’ADN génomique
Salle extraction ADN Trace
Salle d’extraction d’ADN environnemental sous PSM
Salle pré-PCR ADN Trace
Salle de préparation des PCR à partir d’échantillons d’ADN environnemental
Salle post-PCR
Salle dans laquelle nous lançons les PCRs, préparons les gels d’électrophorèse ou encore les librairies d’amplicons. Nous pouvons également quantifier l’ADN grâce au QubitFlex et vérifier les taille de librairies avec la TapeStation
Salle de microbiologie
Salle de microbiologie
Salle de collections
Salle de collections
